Цели освоения дисциплины
Правительство Российской Федерации Федеральное государственное автономное образовательное учреждение высшего профессионального образования
Московский институт электроники и математики Национального исследовательского университета "Высшая школа экономики"
Факультет прикладной математики и кибернетики
Программа дисциплины «Механика молекулярных систем»
для направления 010400.68 «Прикладная математика и информатика» подготовки магистра для магистерской программы «Математические методы естествознания и компьютерные технологии»
Автор программы: Ефремов Р.Г., д. ф.-м. н., профессор, efremov@nmr.ru
Одобрена на заседании кафедры прикладной математики «___»____________ 20 г
Зав. кафедрой Карасев М. В.
Рекомендована секцией УМС [Введите название секции УМС] «___»____________ 20 г Председатель [Введите И.О. Фамилия]
Утверждена УС факультета [Введите название факультета] «___»_____________20 г. Ученый секретарь [Введите И.О. Фамилия] ________________________ [подпись]
Москва, 2013
Настоящая программа не может быть использована другими подразделениями университета и другими вузами без разрешения кафедры-разработчика программы. Область применения и нормативные ссылки Настоящая программа учебной дисциплины устанавливает минимальные требования к знаниям и умениям студента и определяет содержание и виды учебных занятий и отчетности. Программа предназначена для преподавателей, ведущих данную дисциплину, учебных ассистентов и студентов направления подготовки 010400.68 «Прикладная математика и информатики», обучающихся по магистерской программе «Математические методы естествознания и компьютерные технологии» изучающих дисциплину «Методы квазиклассического приближения». Программа разработана в соответствии с: · Образовательным стандартом государственного образовательного бюджетного учреждения высшего профессионального образования «Государственный университет – Высшая школа экономики», в отношении которого установлена категория «Национальный исследовательский университет»; · Образовательной программой «Математические методы естествознания и компьютерные технологии» для направления 010400.68 «Прикладная математика и информатика» подготовки магистра; · Рабочим учебным планом университета по направлению 010400.68 «Прикладная математика и информатика» подготовки магистра по программе «Математические методы естествознания и компьютерные технологии», утвержденным в 2013г.
Цели освоения дисциплины Целью освоения дисциплины «Механика молекулярных систем» является ознакомление студентов с основными современными методами молекулярного компьютерного моделирования биологических макромолекул и надмолекулярных систем (на примере белков, биомембран и белок-мембранных комплексов). Биологическая активность белков определяется особенностями их пространственной структуры и динамическим поведением в среде. В настоящее время методы компьютерного моделирования и биоинформатики являются мощными средствами изучения структурно-динамических свойств водорастворимых и мембранных белков, существенно расширяя и дополняя традиционные биофизические подходы. Основное внимание в рамках настоящего курса лекций уделено вычислительным подходам, использующим эмпирические силовые поля - методам молекулярной механики, молекулярной динамики, Монте-Карло. Рассматриваются теоретические основы указанных подходов, используемые физические модели и математические алгоритмы. Обсуждаются комбинированные подходы к постановке вычислительного эксперимента – с использованием набора in silico технологий. Возможности и ограничения методов молекулярного моделирования иллюстрируются на примерах реальных научных проблем. Специальные разделы курса посвящены актуальным разделам современной биофизики - учету эффектов сольватации в расчетах сложных биологических систем и моделированию мембранных и мембрано-активных пептидов и белков. Поскольку современный уровень развития нанобиотехнологий и достижение значимых результатов в этой области немыслимы без широкого использования компьютерного моделирования, данная дисциплина занимает одно из ведущих мест в программе подготовки бакалавров. Указанные специалисты должны не только свободно владеть компьютерными технологиями для обработки результатов экспериментов, подготовки отчетов, презентаций и пр., но и должны уметь оценивать и прогнозировать свойства и механизмы функционирования изучаемых биомолекулярных систем и наноконструкций с помощью вычислительного эксперимента. Это поможет рационально интерпретировать результаты традиционных биофизических исследований, даст возможность планирования новых экспериментов, будет способствовать формированию у обучающихся единой - теоретической и практико-ориентированной – картины изучаемых сложных объектов и явлений. Эти навыки необходимы обучающимся по всем специальностям данного направления. Важной отличительной особенностью курса является то, что большинство из рассматриваемых в нем примеров взяты из исследований, проводимых авторами в Лаборатории моделирования биомолекулярных систем Института биоорганической химии РАН. Читайте также: I. ХАРАКТЕРИСТИКА ДИСЦИПЛИНЫ Рекомендуемые страницы: Читайте также: Почему стероиды повышают давление?: Основных причин три... Как построить свою речь (словесное оформление):
При подготовке публичного выступления перед оратором возникает вопрос, как лучше словесно оформить свою... ©2015-2020 megaobuchalka.ru Все материалы представленные на сайте исключительно с целью ознакомления читателями и не преследуют коммерческих целей или нарушение авторских прав. (494)
|
Почему 1285321 студент выбрали МегаОбучалку... Система поиска информации Мобильная версия сайта Удобная навигация Нет шокирующей рекламы |