Классификация вирусов.

С ростом числа обнаруженных вирусов были предприняты первые попытки классификации внутри этой самостоятельной группы. В качестве критериев использовали сходство их патогенных свойств

, органотротность ( гепатита, энцефаломиелита), общность экологического статуса (арбовирусы). При этом происходило объединение весьма различающихся, как было выяснено впоследствии, групп вирусов. Одна из первых классификаций состояла в разделении вирусов по принципу поражения отдельных хозяев, а именно на вирусы растении, животных, насекомых и фаги.

Затем вирусы разделили по принципу тропизма: нейротропные, дерматотропные, пневмотропные и пантропные. Однако такая классификация не удовлетворяла основного требования систематики живых существ по степени эволюционного развития и деления по основным сходным признакам.

Чтобы исправить положение, в 1966 году на международном микробиологическом конгрессе в Москве был учрежден Международный комитет по номенклатуре вирусов /МКНВ/. В 1973 году он был переименован в Международный комитет по таксономии вирусов /МКТВ/, который выделил вирусы в отдельное третье царство и в 2000 году, изложил современную систему классификации и номенклатуру вирусов.

Одной из основных целей универсальной таксономической системы является однозначная идентификация вирусов. В последнее время это приобрело особое значение из-за возникновения эмерджментных - инфекций, вызванных новыми вирусами, или известными вирусами в измененных экологических условиях вирусная геморрагическая болезнь кроликов, респираторно-репродуктивный синдром свиней и другие. Вирусы не оставили каких- либо палеонтологических следов, и полагают, что данных о наличии у различных таксонов общих эволюционных корней нет.

 

Вирусы классифицируются по 11 признакам:

1. тип нуклеиновой кислоты, ее структура, количество нитей

2. вид репликации вирусного генома

3. наличие липопротеидной оболочки

4. размер и строение вириона, тип симметрии, число капсомеров

5. тип генетического взаимодействия с клеткой

6. устойчивость к физико-химическим факторам

7. круг восприимчивых хозяев

8. патогенность, в т.ч. и на клеточном уровне

9. географическое распространение, где резервуары

10. способ передачи

11. антигенные свойства

 

Современная универсальная система классификации вирусов использует иерархические уровни /таксоны/ соответствующие порядку, семейству, подсемейству, роду и виду.

Семейство - это группа родов с общими характеристиками, отличающимися по первым 4 признакам от вирусов других семейств.Род - группа вирусов с определенными общими характеристиками и отличавшимися от вирусов других родов.

Вид это- группа вирусов, характеризующаяся большим числом критериев, образующих реплицирующуюся линию и занимающая особую экологическую нишу.

В настоящее время известно 3600 вирусов Всего классифицируют 1550 вирусов, на 56 семейств, 9 подсемейств и 233 рода. .

Вирус позвоночных входит в 28 семейств 10 из которых ДНК содержащие и 18 РНК содержащие.

ДНК - содержащие:

1. Рохviridae

2. Iridoviridae

3. Негреsviridae

4.Аdenoviridae

5. Рароviridae

6. Рагоvoviridae

7. Нераdnaviridae

8. Аsfarviridae

9. Рарillomaviridae

10. Сiгсоviridae

РНК - содержащие

1. Retroviridae

2. Reoviridae

3. Вiгnaviridae

4. Рагаmyxoviridae

5. Rhabdoviridae

6. Filoviridae

7. Огthomyxoviridae

8. Bunyaviridae

9. Агеnaviridae

10. Рiсоrnaviridae

11. Саliciviridae

12. Аstroviridae

13. Соronaviridae

14. Flaviviridae

15. Тоgaviridae

16. Nodaviridae

17. Воrnaviridae

18. Агteriviridae

Вместе с тем выделяют субвирусные агенты - сателиты /род. Deltavirus и прионы, а также неклассифицированные вирусы.

Понятие о криптограмме. В 1966 г. предложили /Гибес и др./ ввести кодированную запись вирусов виде криптограмм, которые состоят из 4-х пар символов:

1 пара: в числителе тип НК /ДНК - Д, РНК – Р/, через дробь указывается число ее нитей /2-двухвалентная 1-одноцепочная/;

2 пара: молекулярная масса НК /в млн. дальтон/ и через дробь,

% нуклеиновой кислоты в вирионе;

З пара: форма вириона, а через дробь форма капсида, для обозначения которых применяют следующие символы:

“S” - сферическая

“Е” - продолговатая с незакругленными концами;

“U” - продолговатая с закругленными концами;

“Х” - комплексная структура.

4. пара: хозяин, а через дробь - переносчик вируса, для их обозначения используют следующие символы:

“А” - актиномицеты

“В” - бактерии

“F” - грибы;

“I” – беспозвоночные

“V” - позвоночные;

“Ас” - клещи и клещики;

“Di” - мухи и комары;

“Ар” - тли;

“Si - блохи

“S” - семенные растения;

“Ne” - нематоды.

“О” - через окружающую среду /т.е. нет переносчика/

“*” - свойства не изучены.

Криптограмма вируса ящура, например, выглядит следующим образом:

Р/1: 2,8/30: S/S: V/О

т.е. однонитчатая РНК, молекулярная масса нуклеиновой кислоты равна 2,8 дальтон; РНК составляет 30% массы вириона; наружное очертание вириона и капсида - сферическое; хозяин - позвоночные и распространение вирусаидет через окружающую среду.